Учебно-методический комплекс дисциплины «Нуклеиновые кислоты»


Конформация полинуклеотидной цепи



жүктеу 7,52 Mb.
бет11/117
Дата28.09.2023
өлшемі7,52 Mb.
#43588
түріУчебно-методический комплекс
1   ...   7   8   9   10   11   12   13   14   ...   117
КОНСПЕКТЫ ЛЕКЦИЙ

Конформация полинуклеотидной цепи
Конформация полинуклеотидной цепи определяется набором торсионных углов (или углов вращения группы атомов относительно связи) сахарофосфатного остова, состоящего из периодически повторяющихся атомов P, O5', C5', C4', C3', O3'. Общий ход полинуклеотидной цепи определяется шестью торсионными углами α, β, γ, δ, ε, η, характеризующими повороты вокруг шести повторяющихся связей P–O5', O5'–C5', C5'– C4', C4'–C3', C3'–O3', O3'–P. Система нумерации атомов и определение торсионных углов для полинуклеотидной цепи даны на рис. 2.5.

Рис. 2.5. Торсионные углы

Вращение относительно связи С4'–C5' в нуклеотидах и нуклеиновых кислотах играет решающую роль в расположении 5'-фосфатной группы относительно сахара и основания. Вращаясь вокруг связи С4'–С5', атом О5' по-разному ориентируется относительно фуранозного кольца. Атом О5' может располагаться над сахарным фрагментом или направлен от него. Величина угла вращения вокруг N-гликозидной связи (торсионный угол χ) определяет взаимное расположение фуранозного цикла и гетероциклического основания (син- или анти-конформации нуклеозидов). На пространственную структуру нуклеиновых кислот оказывает влияние и конформация фуранозного цикла рибозы или дезоксирибозы.


Двуспиральные структуры могут образовывать полинуклеотидные цепи как ДНК, так и РНК. Возможно также образование смешанных комплексов, в которых одна цепь имеет полирибонуклеотидную природу, а другая – полидезоксирибонуклеотидную. Конформационные изменения в спиральных полинуклеотидах сопряжены с согласованными изменениями всех торсионных углов. Обычно для описания спирали нуклеиновой кислоты удобнее использовать так называемые спиральные параметры (таблица 2.1). Спирали могу быть правыми или левыми. Правыми называют такие спирали, в которых при взгляде вдоль оси спирали каждый следующий элемент смещен относительно предыдущего по часовой стрелке.
Комплементарность оснований обеспечивается системой водородных связей. Азотистое основание аденин (A) всегда взаимодействует только с комплементарным ему азотистым основанием тимин (T) в молекулах ДНК. Одновременно азотистое основание гуанин (G) одной цепи взаимодействует только с комплементарным ему азотистым основанием цитозин (C) другой цепи (как в ДНК, так и в РНК). В молекулах РНК, имеющих в основном однонитевую структуру, на отдельных участках азотистое основание А может взаимодействовать с комплементарным ему азотистым основанием урацил (U). Так же осуществляется взаимодействие оснований в процессе транскрипции, когда на матрице ДНК синтезируется молекула РНК (матричная, транспортная и т.д.), а также когда при участии обратной транскриптазы происходит синтез кДНК на матрице РНК.
В 1963 г. при совместной кристаллизации мономерных производных аденина и урацила К. Хугстин (Hoogsteen) наблюдал образование пар А–U, отличных от уотсон-криковских. Обнаруженная им схема спаривания носит название Хугстиновских взаимодействий (Hoogsteen base pairs). Благодаря этим взаимодействиям происходит образование трех- и четырехнитевых участков ДНК

жүктеу 7,52 Mb.

Достарыңызбен бөлісу:
1   ...   7   8   9   10   11   12   13   14   ...   117




©g.engime.org 2024
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет
рсетілетін қызмет
халықаралық қаржы
Астана халықаралық
қызмет регламенті
бекіту туралы
туралы ережені
орталығы туралы
субсидиялау мемлекеттік
кеңес туралы
ніндегі кеңес
орталығын басқару
қаржы орталығын
қаржы орталығы
құрамын бекіту
неркәсіптік кешен
міндетті құпия
болуына ерікті
тексерілу мемлекеттік
медициналық тексерілу
құпия медициналық
ерікті анонимді
Бастауыш тәлім
қатысуға жолдамалар
қызметшілері арасындағы
академиялық демалыс
алушыларға академиялық
білім алушыларға
ұйымдарында білім
туралы хабарландыру
конкурс туралы
мемлекеттік қызметшілері
мемлекеттік әкімшілік
органдардың мемлекеттік
мемлекеттік органдардың
барлық мемлекеттік
арналған барлық
орналасуға арналған
лауазымына орналасуға
әкімшілік лауазымына
инфекцияның болуына
жәрдемдесудің белсенді
шараларына қатысуға
саласындағы дайындаушы
ленген қосылған
шегінде бюджетке
салығы шегінде
есептелген қосылған
ұйымдарға есептелген
дайындаушы ұйымдарға
кешен саласындағы
сомасын субсидиялау