Учебно-методический комплекс дисциплины «Нуклеиновые кислоты»

Сокращения, используемые для обозначения нуклеотидов

жүктеу 7,52 Mb.

бет	7/117
Дата	28.09.2023
өлшемі	7,52 Mb.
	#43588
түрі	Учебно-методический комплекс

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ... 117

КОНСПЕКТЫ ЛЕКЦИЙ

Название Сокращения

Сокращения, используемые для обозначения нуклеотидов

Название		Сокращения
Название		Русское	Латинское
Аденозин-5'-монофосфат	Аденилат (адениловая кислота)	АМФ	AMP
Аденозин-5'-дифосфат		АДФ	ADP
Аденозин-5'-трифосфат		АТФ	ATP
Гуанозин-5'-монофосфат	Гуанилат (гуаниловая кислота)	ГМФ	GMP
Гуанозин-5'-дифосфат		ГДФ	GDP
Гуанозин-5'-трифосфат		ГТФ	GTP
Цитидин-5'-монофосфат	Цитидилат (цитидиловая кислота)	ЦМФ	CMP
Цитидин-5'-дифосфат		ЦДФ	CDP
Цитидин-5'-трифосфат		ЦТФ	CTP
Уридин-5'-монофосфат	Уридилат (уридиловая кислота)	УМФ	UMP
Уридин-5'-дифосфат		УДФ	UDP
Уридин-5'-трифосфат		УТФ	UTP
Тимидин-5'-монофосфат	Тимидилат (тимидиловая кислота)	ТМФ	TMP
Тимидин-5'-дифосфат		ТДФ	TDP
Тимидин-5'-трифосфат		ТТФ	TTP

Для дезоксирибонуклеотидов, содержащих в качестве гетероциклов аденин, гуанин и цитозин, используются те же названия, но с приставкой дезокси-. Например, дезоксиаденозин-5'-монофосфат, или дезоксиаденилат, сокращенно дАМФ или dAMP. Для тимидилата приставку дезокси- обычно опускают, поскольку для него характерна дезоксиформа.

В организме могут образовываться также циклические нуклеотиды, когда фосфат связывает 2 атома кислорода пентозного остатка в одном и том же нуклеотиде (рис. 1.21). Фосфодиэфирные связи в рибонуклеотидах формируются между 2'- и 3'-гидроксилами или между 3'- и 5'-гидроксилами, а в дезоксирибонуклеотидах – между 3'- и 5'-гидроксилами.

Рис. 1.21. Циклические нуклеотиды

Одним из представителей таких циклических диэфиров является аденозин-3',5'-циклофосфат (3',5'-АМР, сАМР, А>p). Циклический 3',5'-АМФ образуется из АТФ в процессе реакции, катализируемой ферментом аденилатциклазой. Он обладает высокой биологической активностью и играет важную роль в регуляции процессов обмена, выполняя роль медиатора внеклеточных сигналов в клетках животных.

Мононуклеотиды, присоединяя еще один остаток фосфата, образуют фосфоангидридную связь (наподобие связи, имеющейся в пирофосфате) и превращаются в нуклеозиддифосфаты. Они обозначаются сокращенно АДФ, ГДФ, УДФ, ЦДФ, соответственно. Последние, присоединяя еще один остаток фосфата, образуют нуклеозидтрифосфаты, которые обозначаются АТФ, ГТФ, УТФ, ЦТФ, соответственно (рис. 1.22). То же самое относится и к нуклеотидам дезоксирибозного ряда. Это дезоксирибонуклеозид-5'-дифосфаты дАДФ, дГДФ, дЦДФ и ТДФ, и дезоксирибонуклеозид-5'-трифосфаты дАТФ, дГТФ, дЦТФ и ТТФ.

Рис. 1.22. Схема образования молекул аденозинди- и аденозинтрифосфатов
Нуклеозиддифосфаты могут содержать два фосфатных остатка в разных положениях рибозы или дезоксирибозы. При кислотном гидролизе ДНК образуются 3’,5’-дифосфаты пиримидиновых дезоксирибонуклеотидов (в пуриновых нуклеотидах при этих условиях происходит гидролиз гликозидной связи. При щелочном гидролизе РНК образуется смесь рибонуклеозид-3',5' и -2',5'-дифосфатов.
В богатых энергией ди- и трифосфатах олигофосфатный остаток присоединяется к сахару по 5'-положению; в результате образуется, например, аденозинтрифосфат (ATP, pppA, Ado-5'PPP). Положение фосфатных групп обозначают греческими буквами α, β, γ. Аналогичным образом образуются олигофосфаты других нуклеотидов.
Нуклеозидтрифосфаты являются предшественниками в ферментативном синтезе ДНК и РНК. Однако в клетках имеются свободные нуклеозидтрифосфаты, не принимающие участия в биосинтезе нуклеиновых кислот, но выполняющие жизненно важные функции. В частности, одной из важнейших функций нуклеозидтрифосфатов и особенно АТФ является их участие в биоэнергетике всех живых организмов. При гидролизе аденозинтрифосфата могут образоваться аденозиндифосфат (ADP, ppA) или
aденозинмонофосфат (адениловая кислота, 5'-AMP).
Нуклеотиды обычно выделяют из нуклеиновых кислот после ферментативного или химического гидролиза ДНК или РНК. Для разделения нуклеотидов используют разные виды хроматографии.

жүктеу 7,52 Mb.

Достарыңызбен бөлісу:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ... 117