Учебно-методический комплекс дисциплины «Нуклеиновые кислоты»


Субстратоподобные ингибиторы



жүктеу 7,52 Mb.
бет58/117
Дата28.09.2023
өлшемі7,52 Mb.
#43588
түріУчебно-методический комплекс
1   ...   54   55   56   57   58   59   60   61   ...   117
КОНСПЕКТЫ ЛЕКЦИЙ

8.1. Субстратоподобные ингибиторы in vitro
По принципу своего действия ингибиторы этого типа являются аналогами природных субстратов. Они связываются с ДНК-синтезирующим комплексом (праймер + матрица + ДНК-полимераза) и далее ингибируют процесс удлинения цепи по тому или иному механизму.
Ингибирование удлинения цепи может быть вызвано следующими причинами:
а) простой конкуренцией с природным субстратом, не приводящей, однако, к каким-либо химическим реакциям;
б) конкуренцией с субстратом, осуществляемой вплоть до включения в 3'- конец цепи и далее, во внутренние положения цепи ДНК;
в) конкуренцией с субстратом за включение в 3'-конец цепи и вызванной этим включением остановкой роста цепи ДНК.
Все три механизма ингибирования определяют общие требования к структуре субстратоподобных ингибиторов. Молекулы таких ингибиторов должны содержать три основных элемента природного субстрата, а именно: нуклеиновое основание, сахарный остаток и 5'-трифосфатную группировку. При этом структура какой-либо из этих частей молекулы имеет измененное строение и тем самым придает молекуле новые биологические свойства. Однако это изменение не должно слишком сильно изменять электронную и конформационную структуру молекулы в целом, иначе такое соединение не будет узнаваться комплексом (матрица + праймер + ДНК-полимераза). Для того чтобы соединение проявляло субстратные свойства, в нем должны быть сохранены α-β пирофосфатная связь и 3'-гидроксил. Для терминации цепи ДНК 3'-гидроксил должен быть заменен на какую-либо другую группу с сохранением 2'-дезоксирибо-конфигурации.
8.1.1. Модификации оснований в аналогах dNTP
Многие аналоги субстратов синтеза ДНК, содержащие в своей структуре модифицированное по сравнению с природными субстратами основание, способны включаться в растущую цепь ДНК. Степень такого включения зависит от того, способны ли аналоги субстратов узнаваться комплексом [ДНК + ДНК-полимераза]. Чем выше сродство аналогов субстратов, тем выше частота их включения. Некоторые аналоги с модификацией по основанию либо не проявляют никакой ингибиторной активности, либо являются слабыми конкурентными ингибиторами. Замена природного нуклеинового основания на аналог приводит к ухудшению спаривания с комплементарным основанием матрицы и, как следствие, к замедлению общего процесса удлинения цепи ДНК. Очень часто включение аналога в цепь ДНК приводит при последующих раундах репликации к мутагенезу.
Отбор ДНК-синтезирующими комплексами аналогов субстратов существенно хуже, чем природных dNTP, не соответствующих своему нуклеотиду в матрице. Это объясняется, по-видимому, тем, что эволюция была направлена именно на обеспечение точности выбора между природными субстратами. Таким образом, именно аналоги субстратов являются наиболее опасными соединениями с точки зрения ненаправленного мутагенеза. Наиболее сильными мутагенными свойствами обладают нуклеотиды, имеющие модифицированные основания, но хорошо образующие пары с основаниями матрицы (производные 2,6-диаминопурина, 5-галоидурацила и др.). Более слабый эффект оказывают модифицированные нуклеотиды, дающие слабые водородные связи или вообще их не дающие (производные бензимидазола, 2-аминопурина, метилированные по N3 пиримидины и др.).
Модифицированные по основанию аналоги субстратов, обладающие слабыми субстратными свойствами, включаются в цепь ДНК, но с меньшими скоростями. Аналоги dTTP по 5 положению используются в качестве субстратов многими ДНК-полимеразами, особенно вирусными. Галоид-замещенные dUTP(5R) (R = Br, Cl, F, I) являются хорошими субстратами для многих ДНК-полимераз. Эти соединения используются для терапии раковых и вирусных заболеваний.

жүктеу 7,52 Mb.

Достарыңызбен бөлісу:
1   ...   54   55   56   57   58   59   60   61   ...   117




©g.engime.org 2024
әкімшілігінің қараңыз

    Басты бет
рсетілетін қызмет
халықаралық қаржы
Астана халықаралық
қызмет регламенті
бекіту туралы
туралы ережені
орталығы туралы
субсидиялау мемлекеттік
кеңес туралы
ніндегі кеңес
орталығын басқару
қаржы орталығын
қаржы орталығы
құрамын бекіту
неркәсіптік кешен
міндетті құпия
болуына ерікті
тексерілу мемлекеттік
медициналық тексерілу
құпия медициналық
ерікті анонимді
Бастауыш тәлім
қатысуға жолдамалар
қызметшілері арасындағы
академиялық демалыс
алушыларға академиялық
білім алушыларға
ұйымдарында білім
туралы хабарландыру
конкурс туралы
мемлекеттік қызметшілері
мемлекеттік әкімшілік
органдардың мемлекеттік
мемлекеттік органдардың
барлық мемлекеттік
арналған барлық
орналасуға арналған
лауазымына орналасуға
әкімшілік лауазымына
инфекцияның болуына
жәрдемдесудің белсенді
шараларына қатысуға
саласындағы дайындаушы
ленген қосылған
шегінде бюджетке
салығы шегінде
есептелген қосылған
ұйымдарға есептелген
дайындаушы ұйымдарға
кешен саласындағы
сомасын субсидиялау