10.3.3. Терминация
Прекращение синтеза РНК, катализируемого РНК-полимеразой, и освобождение РНК из транскрипционного комплекса происходят на терминаторах транскрипции – особых участках ДНК в конце транскрипционных единиц. Терминаторы транскрипции, функционирующие с разной эффективностью, могут находиться и внутри транскриптонов, регулируя уровень транскрипции соответствующих генов.
Терминация транскрипции на некоторых терминаторах может не зависеть от дополнительных белковых факторов, тогда как другие терминаторы в их отсутствие не функционируют. Терминаторы транскрипции, не требующие для своего распознавания РНК-полимеразой E. coli дополнительных белковых факторов, содержат GC-богатый участок, обладающий центральной симметрией, вслед за которым располагается последовательность нуклеотидов, состоящая из выстроенных подряд четырех–восьми остатков A в матричной цепи ДНК. Транскрипция палиндромного участка ДНК приводит к формированию шпильки из РНК. Она богата GC-парами, что делает ее более стабильной, нежели гибрид ДНК–РНК. В результате происходит разрушение этого участка ДНК–РНК гибрида в транскрипционном комплексе. Оставшаяся часть ДНК–РНК гибрида нестабильна и легко плавится, поскольку образована 3'-концевой олиго(U)-последовательностью РНК и олиго(dA)-последовательностью терминатора. Сначала из комплекса освобождается молекула РНК, а затем кор-фермент РНК-полимеразы. Эффективность терминации транскрипции на таком терминаторе зависит от стабильности терминаторной шпильки. Отделившийся холофермент РНК-полимеразы после объединения со свободной σ-субъединицей может вступать в новый цикл транскрипции.
В E. coli обнаружены терминаторы транскрипции, распознаваемые РНК-полимеразой только в присутствии специфического белкового фактора ρ. Этот белок с молекулярной массой 46 kD обладает РНК-зависимой нуклеозидтрифосфатазной активностью, которая необходима для его функционирования при терминации. Кроме того, для него характерна РНК:ДНК-хеликазная активность. Белковый фактор ρ связывается с растущей цепью РНК в особых участках до того, как РНК-полимераза достигает терминатора, и фермент прекращает элонгацию. Считается, что роль ρ-фактора заключается в вытеснении РНК из транскрипционного комплекса во время пауз. E.coli и другие бактерии имеют еще один тип регулируемых терминаторов транскрипции, называемых аттенюаторами.
У эукариот обнаружены три фактора терминации транскрипции, необходимых для освобождения РНК-полимераз из транскрипционных комплексов на терминаторах, – по одному для РНК-полимераз I, II и III.
Освободившийся из транскрипционного комплекса первичный транскрипт РНК, или про-мРНК, в большинстве случаев длиннее, чем последовательность нуклеотидов, соответствующая конечному продукту (полипептиду, тРНК, рРНК). Первичный РНК-транскрипт претерпевает изменения, в совокупности называемые процессингом, и превращается в зрелую РНК.
Необходимо отметить, что инициация синтеза РНК, элонгация транскриптов и терминация транскрипции являются очень сложно организованными процессами. На функционирование РНК-полимераз оказывают действие многочисленные белковые факторы. Структуры матричной ДНК и растущих цепей РНК также влияют как на свойства ферментов, так и на инициацию, задержку и прекращение транскрипции и ее терминацию. Имеются данные, что транскрипционный комплекс взаимодействует с другими крупными белковыми комплексами, участвующими, в частности, в разрушении нуклеосом и репарации ДНК. При этом образуется стабильный транскрипционный комплекс, содержащий более 70 полипептидов. Это привело к формированию концепции транскриптосомы – специализированных надмолекулярных комплексов, специфически ассоциированных с ядерным матриксом.
Достарыңызбен бөлісу: |