Терминация синтеза линейных вирусных ДНК
У многих одноклеточных организмов и вирусов хромосомы имеют кольцевую форму либо же геном производит кольцевые промежуточные продукты репликации, у которых нет концов и, следовательно, не существует проблемы недорепликации.
У линейных вирусных ДНК известно несколько механизмов терминации синтеза. Синтез вирусной ДНК может инициироваться на конце хромосомы с использованием в качестве затравки особого концевого белка (TP), ковалентно связывающегося с нуклеотидом на 3'-конце материнской цепи, и продолжается через весь геном до его конца. Тогда дочерние цепи синтезируются полными. Так происходит у аденовирусов (рис. 5.11, б).
Рис. 5.11. Модели достройки теломерных участков хромосом и плазмид Streptomyces.
У покс- и парвовирусов завершение синтеза ДНК происходит на специальных концевых палиндромных проследовательностях – "кроличьих ушах". Одноцепочечный участок образует шпильку, 3'-конец которой служит затравкой для синтеза ДНК. После застройки бреши происходит расщепление цепи ДНК эндонуклеазой. После разворачивания шпильки застраивается вторая дочерняя цепь (рис. 5.11, д).
Модели заполнения брешей в линейных хромосомах бактерий
Линейные хромосомы у бактерий широко распространены в природе и часто сосуществуют с линейными плазмидами. Линейные хромосомы и плазмиды наиболее хорошо изученных в этом отношении бактерий рода Streptomyces на концевых участках содержат инвертированные повторы (TIR), так называемые теломеры. С ними ковалентно связаны концевые белки (TP). Репликация начинается с внутренней области начала репликации oriC, распространяется в обе стороны от области начала репликации по стандартному полуконсервативному механизму и завершается на концах линейных молекул ДНК с образованием 3'-концевых брешей (рис. 5.11, а).
Стрептомицеты используют ТР для репликации теломерных участков, однако механизм распознавания теломер в данном случае иной. Существуют три модели заполнения брешей в теломерных участках линейных хромосом бактерий.
Первая. Одноцепочечный участок теломеры, содержащий концевые инвертированные повторы (TIR), образует концевую шпильку (рис. 5.11, в). Синтез ДНК, репарирующий одноцепочечную брешь, инициируется на двухцепочечном участке, образованном палиндромными последовательностями I-IV с участием ТР и ДНК-полимеразы, и продолжается вдоль 3'-концевого одноцепочечного участка хромосомы.
Согласно второй модели ТР инициирует репликацию на полностью двухцепочечной дочерней ДНК и вытесняет 5'-концевую цепь родительской ДНК, с которой связан ТР (рис. 5.11, г ). Вытесняемая цепь далее спаривается с выступающим 3'-концом хромосомы. Образовавшаяся разветвленная структура разрешается с помощью гомологичной рекомбинации при участии белка RecA (для переноса цепи ДНК) и продуктов генов ruv для разрешения структуры Холидея.
Третья модель аналогична модели механизма репликации генома парвовирусов. Одноцепочечный палиндром I образует шпильку, 3'-конец которой служит затравкой для синтеза ДНК, в результате которого заполняется брешь (рис. 5.11, д). ТР образует напротив первоначального 3'-конца одноцепочечный разрыв, который является затравкой для последующего синтеза ДНК. В результате шпилька разворачивается и восстанавливается структура теломеры. В данной модели роль ТР отличается от его функций в качестве белка-затравки в рассмотренных выше примерах.
Достарыңызбен бөлісу: |