Три примера задач домашних заданий

cpm (counts per minute; импульсы распада в мин):

Аликвота для счета радиоактивности 10 мкл

Концентрация белка 0,015 мг/мл

Рассчитать величину V_max при этой концентрации белка

Молекулярная масса белка 150 000 у е

Рассчитать величину k_cat

исходя из данных таблицы

х 10³, М х 10⁴, М реакции, М х мин^-1

0 4.1 2.08

1,00 1,67

625. 
     1,43
     

0,417 1,25

0,264 1,00
4.1 1.96

1,67 1,67

0,6 1,00 1,47

625. 
     1,18
     

10.63 1.88

5.0 1,56

3,0 1,67 1,00

1,00 0,77

0,667 0,57

0,5 0,45

Задача 3.
Кофермент А (СоА) является ингибитором реакции, катализируемой фосфат-ацетилтрансферазой. В таблице приведены данные по влиянию СоА на начальную скорость реакции. Определить тип ингибирования реакции СоА по отношению к нуклеотидному субстрату и неорганическому субстрату и вычислить соответствующие константы ингибирования.

СоА 10⁵,М Ас-СоА10⁵,М фосфат 10², М Скорость

V, M/ мин

____________________________________________________________________

0 3,5 6,1 2.94

2.5 3,5 6,1 2,18

4.0 3,5 6,1 1,88

6.7 3,5 6,1 1,50

12.0 3,5 6,1 1,09
0 8,5 6,1 6,25

4,0 8,5 6,1 4,35

12,0 8,5 6,1 2,64

18,0 8,5 6,1 2,04

21,0 8,5 6,1 1,82

0 12,5 6,1 7,7

4,0 12,5 6,1 5,3

8,0 12,5 6,1 4,0

12,0 12,5 6,1 3,3

16,0 12,5 6,1 2,8

22,0 12,5 6,1 2,22

0 7,4 2,0 1,74

3,0 7,4 2,0 1,3

7,5 7,4 2,0 0,935

10,0 7,4 2,0 0,815

17,5 7,4 2,0 0,582

0 7,4 4,0 2,94

6,0 7,4 4,0 1,75

10,0 7,4 4,0 1,39

15,0 7,4 4,0 1,09

22,0 7,4 4,0 0,835

0 7,4 6,0 3,85

5,5 7,4 6,0 2,38

10,0 7,4 6,0 1,82

16,0 7,4 6,0 1,39

25,5 7,4 6,0 0,99

1. 
   Причины ускорения реакций, катализируемых ферментами
   
2. 
   Кинетика предстационарных реакций
   

1. 
   Активный центр карбоксипептидазы и механизм ее действия
   
2. 
   Явление кооперативности у ферментов и их количественная оценка
   

1. 
   Активный центр рибонуклеазы и механизм ее действия
   
2. 
   Описание взаимодействия аффинного реагента с ферментом (не затрагивая конкурент)
   

1. 
   Нуклеофильный катализ и его особенности
   
2. 
   Описание взаимодействия аффинного реагента с ферментом и конкурентным по отношению к нему лигандом
   

1. 
   Лаврик О. И., Дырхеева Н. С. Основы ферментативного катализа, Новосибирск, РИО НГУ, 2012.
   
2. 
   Кудряшова Н.В., Алексеев П.В.,Халимская Л.М. Ферментативная кинетика. Учеб. пособие. - Новосибирск: Изд-во НГУ. 2007. 36 с.
   
3. 
   Фершт Э. Структура и механизм действия ферментов, Москва, Мир, 1980.
   
4. 
   Дюга Г. и Пенни К. Биоорганическая химия, Москва, Мир, 1983.
   
5. 
   Курганов Б. И. Аллостерические ферменты, Москва, Наука, 1978.
   
6. 
   Аффинная модификация ферментов/под. ред. Кнорре Д.Г., Наука, 1983.
   
7. 
   Корниш-Боуден Э. Основы ферментативной кинетики, Москва, Мир, 1979.
   
8. 
   Килети T. Основы ферментативной кинетики, Москва, Мир, 1990.
   
9. 
   Диксон М. и Уэбб Э. Ферменты, Москва, Мир, том 1-3, 1966
   
10. 
    
    

11. 
    Классификация и номенклатура ферментов, под ред. Браунштейна А. Е., Издательство иностранной литературы, 1962.
    
12. 
    Невинский Г.А., Важная роль слабых взаимодействий при узнавании ферментами протяженных молекул ДНК и РНК, Молекулярная биология, 1995, 29, 16-37.
    
13. 
    Бугреев Д.В., Невинский Г.А. Возможности метода постадийного усложнения лиганда в исследовании белково-нуклеиновых взаимодействий: механизмы функционирования некоторых ферментов репликации, репарации, топоизомеризации и рестрикции. Биохимия, 1999, 64, 291-305.
    

• 
  В качестве технического обеспечения лекционного процесса используется ноутбук, мультимедийный проектор, доска.
  
• 
  Для демонстрации иллюстрационного материала используется программа Microsoft Power Point 2003.
  
• 
  Проведение домашних работ и экзамена обеспечивается печатным раздаточным материалом.
  

Программа составлена в соответствии с требованиями ФГОС ВПО с учетом рекомендаций ПООП ВПО по направлению «0200400 Биология», а также в соответствии с Образовательным стандартом высшего профессионального образования, принятым в Федеральном государственном бюджетном образовательном учреждении высшего профессионального образования Новосибирский государственный университет.

«23» января 2015  года